孔子晚年喜欢钻研《易经》，并且详细解释了《系》、《象》、《说卦》、《文言》等篇。他对《易经》爱不释手，以至于韦编三绝。他说：“如果我还能多活几年的话，那么，对《易经》的文辞和义理就能充分掌握了。”
孔子用《诗》、《书》、《礼》、《乐》作为教材，跟随他学习的弟子大约有三千人，其中，精通六艺的有七十二人。至于像颜浊邹那样的、多方面受到孔子教诲而不在七十二弟子之列的人，则非常的多。
孔子教育弟子注重抓四个方面：学问、言行、忠恕、信义。他要求弟子们严格执行四禁：不揣测、不武断、不固执、不自以为是。他认为应该谨慎处理的是：斋戒、战争、疾病。孔子很少谈及利益，如果谈及，就和命运、仁德联系起来。孔子授课，不到弟子难得发急时，就不去启发、开导他。如果弟子们不能举一反三、触类旁通，孔子就不再讲授新课。
圣人为人
孔子在家乡的时候，谦恭的像个不善言谈的人。但是，在宗庙祭祀和朝廷议政的时候，他的言辞却明晰通达、滔滔不绝，但却很谦恭、小心。上朝的时候，孔子和上大夫交谈，态度和气、中正自然；和下大夫交谈，理直气壮、和乐轻松。他进入国君的宫门，就保持低头、弯腰的恭敬姿势；快到国君跟前的时候，他小步快行，两臂后伸，恭敬有礼。国君命令孔子接待宾客，他的表情便十分庄重认真。国君如果召见他，孔子不等车驾备好，就先出发了。
鱼如果不新鲜，肉已经变了味，或者不按照规矩切割，孔子都不吃。席位不端正，孔子就不就座。在有丧事的人旁边吃饭，孔子从来不吃饱。别人哭泣的时候，孔子从来不唱歌。如果看见身着丧服的人或者是盲人，即便那人是小孩，孔子也必定改变面容，来表示悲戚、同情。
孔子说过：“三人行，必有我师。”他又说过：“道德的不修明，学业的不探求，听到正义的事情不能前往学习，对于缺点、错误不能马上改正，这些都使我忧虑。”孔子请人唱歌，如果人家唱得好，孔子就请他再唱一遍，而自己也跟着一块唱。对于怪异、暴力、婬乱、鬼神的事情，孔子从来不谈论。
子贡曾经对孔子说：“先生在文献方面成就卓著，这我们是知道的。而您讲的天道与人生命运的深奥见解，弟子们就不懂了。”颜渊也曾经感慨地说：“弟子对老师的学问越敬慕，就越是觉得它无比的崇高；钻研越深，就越觉得它坚实深厚。先生善于循序渐进的诱导学生，用典籍文章丰富弟子的知识，用礼仪道德规范弟子的言行，弟子纵然想要停止学业都是不可能的。我已经竭尽了自己的才智，好像有所收获，而老师的学问却依然高不可及。达巷这个地方的党人对我说过：‘孔子是多么的伟大啊！他博学多才却不专一名家。’”孔子听到这些话以后，都随之一笑地说：“我要专于什么呢？专于赶车？还是专于射箭？我还是专于赶车吧。”对此，弟子子牢回忆说：“老师曾经说过：‘因为没有被世主任用，所以我才有闲工夫学了许多的技艺’。”
圣人暮年
鲁哀公十四年的春天，哀公在大野地方狩猎。为叔孙氏赶车的锄商猎获了一头怪兽。人们认为这是不祥的兆头。孔子看了看怪兽，对众人说：“这是麒麟啊！”于是，哀公命人将它取走。孔子慨叹地说：“神龙不会再背着宝图出现在黄河上，神龟也不会再背着洛书出现在洛水上了。我的生命即将完结了！”
之前，颜渊死后，孔子悲伤地说：“这是老天爷要我死啊！”等到他跟随国君去西边狩猎而见到了麒麟，孔子感慨地说：“我的主张到头了！没有人能了解我了！”子贡不明白，问孔子说：“您为什么认为没有人能了解您了呢？”孔子回答说：“我从不怨天尤人，下学人事，上通天理，所以，了解我的只有上天了！”
孔子说：“不降低自己的志向，不使自己的人格受侮辱，只有伯夷、叔齐两个人能够做到吧！”他又说：“柳下惠、鲁少连降低了自己的志向，使自己的人格受到了侮辱。虞仲、夷逸隐居，不言世事，行为清高、纯洁，对自我的废弃合于权变。我和这些人就不同了，既没有绝对的可以，也没有绝对的不可以。”