意识一般都是在我们的系统运行出故障时才会参与其中。举例而言，我们平时走路或说话的时候，不太会感觉到这些事到底是怎么发生的。但如果一个人的腿受伤了，他可能才会第一次注意走路到底是怎么一回事（“要想左转，我得把自己朝那个方向推”），那时他才可能会考虑是哪些肌肉在完成这个目标。认为自己感到困惑的时候，我们才会开始反思自己的思维是如何解决问题的，这时才会用上所知的那一点点关于思维策略的知识。之后我们可能会说：
“现在我必须更有条理一些。我为什么不能专注于那些重要的问题，而不被无关紧要的细枝末节分神呢？”
矛盾的是，与困惑而不自知相反，一个人意识到自己感到困惑反而是一件明智的事。因为这样我们才有动力运用自己的智能来改变或修复那些有缺陷的程序。然而我们并不喜欢困惑，还常常蔑视这种状态，没有体会到承认这种状态的好处。
然而，当你的B-脑让你开始询问“我到底想干什么”的时候，你可以以此为契机改变目标或者改变描述当前情境的方式。这样的话，你就能逃离受困的痛苦，因为似乎也没有什么其他选择。对困惑的意识体验和疼痛相似，可能因为二者都会驱使我们寻找逃离困境的方法。不同之处在于困惑直接对抗思维的故障状态，疼痛反映的是外部的干扰。不论哪种情况，都需要拆除和重建内部程序。
困惑和疼痛如果导致我们在更大尺度上放弃而不是珍惜目标，都会产生伤害：“这整个主题都让我感到难受。也许我应该放弃整个项目，放弃我的职业或者关系。”不过就算是这样让人灰心的想法，也能刺激我们去寻找其他有可能提供帮助的智能组。