首飞梯队选定时，距离执行飞行任务只剩下了一个月。这段时间，训练的重点转向飞行程序和实际执行任务。
中国航天员训练和整个航天工程的进展是同步的，没有前车之鉴，没有成功范例，摸索中进行，过程中有很多不成形的、不停变化的状态，形式和内容都不可能固定。
比如，我们的训练是针对神舟系列飞船的，但当时神舟系列飞船的技术状态并没有完全定下来，因此，随着飞船技术和功能的调整，训练大纲和操作细则都必须随时跟着调整，而每调整一次就要重新学一次。打个比方说，相当于在建学校的同时要把学生培养出来，教学大楼还没盖好呢，我们就要想象坐在教室里上课是个啥样，有的课老师还没有，就要找老师，发现还得补上一门课，就得再找老师。
而到了这个阶段，整个航天工程绝大部分技术内容都已经定型，训练目标和训练内容才变得明晰和确凿。
这一个月的强化训练，主要在飞行程序模拟器中进行。用飞行程序模拟器、飞船运动人工控制模拟试验系统等设备，进行正常飞行、应急飞行以及飞行过程中各类故障的判断和处理，有针对性地反复训练。
对这些内容的考评，将决定谁成为首飞航天员。
其实，相关的操作，我们已经训练了无数遍，尤其我们首飞梯队的三个人，都是优中选优的胜出者，那么怎样才能在三个人中间拉开档次呢？这时，专家们给我们设置了一些陷阱。
比如，按正常程序，航天员进舱后首先要对飞船的初始状态进行检查，专家们这时就会故意把状态设置错，看我们能不能及时发现，发现后怎么处置。虽然训练过程都一样，但是我们面对问题的表现肯定是有差别的，哪怕只是细微差别，专家们都会做出评判。
我们连续进行了五次模拟程序考试，我五次的成绩分别是：99.5分，99.7 分，100 分，100 分，100 分，仍然排名第一。
9 月初，李继耐总指挥亲自主持，召开了评选委员会会议，以无记名投票方式对我、翟志刚、聂海胜三人进行了排序，当时的结果并没有公布，尽管如此，我心里还是有比较清楚的感觉：我可能排在第一位，首飞有可能是我。
2003 年 9 月 14 日，全体航天员来到酒泉卫星发射中心，也就是神舟五号发射场，进行最后的训练和选拔。
9月21日到9月24日，首飞梯队的三人进行“人—船—箭—地”联合测试演练。
到了这个时候，可以说我已经对飞船的飞行程序和操作规程滚瓜烂熟、倒背如流。
比如，飞船在实际发射时，起飞后 3 分 20 秒左右，罩在座舱外的“整流罩”将按程序被抛除，航天员在此时可以见到舷窗外的天空。在演练时，这只能是一种想象中的景况，不会实际发生。因此，指挥大厅里的老总们谁也没料到航天员在此时会有什么反应。
我坐在飞船座舱中，之前的所有规定动作都做得一丝不苟、忙而不乱，没有失误。程序刚刚走到 3 分 20 秒时，我认为按实况应当报告这时的状态，于是按照顺利发射时一定会出现的情况，向指挥中心报告：“整流罩抛除，我看到窗外的天空了！”
这并不是训练中的规定动作，所以现场的一位老总惊讶地问我们所长宿双宁：“你们的航天员训练得这么好，连这都知道？”
身为航天医学工程研究所所长、中国载人航天工程航天员系统总指挥兼总设计师，宿双宁对此非常自豪：“开玩笑，你都知道的事，他还能不知道？”
这次合练让我一直以来的感觉得到了印证。
从整个提前演练的环节上看，我们三个人走的程序不一样，我走的是实程序，都是一比一的设备演练，而翟志刚和聂海胜的演练，程序是压缩的。
我告诉自己不可以有半点松懈。我期待着确认心中的那个谜底。
10 月初，我们首飞梯队的三位航天员，都被领导约见单独谈话。总装备部朱增泉副政委负责载人航天飞行的思想工作与宣传工作，他带着一个班子，不仅找我们三个人谈话，还找我们的家属谈话。
首长的谈话内容非常透彻，包括整个行动过程、训练任务和执行任务的思想调整、宣传计划、个人对载人航天工程的认识、如何对待飞和不飞。
我当时汇报说，从训练这个角度，我觉得飞行肯定是没有什么问题的，我只拿它当一次任务，跟训练没什么两样。如果不是我去飞行，我会做好备份，坚持到飞船离地前的最后一秒，随时准备飞。而对于类似如何对待荣誉、名利，那时真的没有多想，也没想到飞行回来会很“出名”。
谈话快结束的时候，朱副政委突然问了我一句：“所里跟你说了吧？”我说：“没有，什么也没说。”他沉吟了一下，说你要保持住，情况很不错的，综合素质排名最高。
在此之前，9 月 30 日，中央电视台《面对面》栏目的王志采访我，这是我第一次接受电视采访。当时，我得到的特殊照顾至今让我印象深刻。
那时，防“非典”还没有结束，要求我接受采访最好穿着防护服，可穿着它上镜效果又很不好，我和王志就都没有穿。
结果，为了保证我的安全，工作人员就用几个大电扇，一直对着王志吹，让他处于下风口，这样，他那边的气息就流通不到我这边来。王志就这样一直顶着风采访我。
那个采访场面对我来说很新鲜，估计王志也是第一次在人造大风中采访，我很感动。国家和人民对我们的厚爱和呵护，让我更加深切地感到了肩上担子的分量，我没有理由亵渎自己的职责。